Обязательно закрыть всасывающую дырку воздухофильтра - в полость и на фильтрующий элемент воде не следует попадать. И это практически единственное критичное место.
Остальные элементы под капотом можно не закрывать и спокойно мыть. Ибо во время эксплуатации влага так или иначе под капот всюду попадает, и не просто влага, а в перемешку с агресивными реагентами. Вот от них-то подкапотное пространство и нужно отмывать - коррозия!
При исправных уплотнителях вода подкапотному пространству не страшна, просто обязана быть не страшна!
Ну а если вдруг после мойки мотор не заведётся, то уж пусть лучше это случится днём и в предсказуемом месте, где до сервиса недалеко. А не среди ночи, в непогоду после лужи на пустынной дороге, вдали от дома.
Не руководство к действию, но лишь моё IMHO. На всех своих авто под капотом мыл всегда, не только от коррозии полезно, но и эстетически приятно!